หน้าที่ความรับผิดชอบ
๑. คณะกรรมการมูลนิธิ มีหน้าที่ วางแผน กำหนดนโยบาย เป้าหมาย และกำกับติดตามการดำเนินงานของมูลนิธิ
๒. ฝ่ายวิชาการมีหน้าที่ จัดทำแผนงาน โครงการต่าง ๆ รวมทั้งการจัดการองค์ความรู้ที่เกี่ยวข้องกับการแพทย์ฉุกเฉินและการจัดอบรมสัมมนาให้ความรู้แก่ภาคีเครือข่ายระดับต่าง ๆ ตลอดจน สนับสนุนการให้ทุนการศึกษา วิจัย เพื่อให้เกิดการพัฒนาด้านการแพทย์ฉุกเฉิน
๓. ฝ่ายประชาสัมพันธ์และสร้างภาพลักษณ์องค์กร มีหน้าที่ ประชาสัมพันธ์กิจกรรม และผลการดำเนินงานต่าง ๆ ที่จัดขึ้น และเผยแพร่ข้อมูลข่าวสารและความรู้ต่าง ๆ แก่สื่อสารมวลชนและสังคม
๔. ฝ่ายการเงินและบัญชี มีหน้าที่ จัดระบบการเงินและบัญชี การรับบริจาค การเบิกจ่าย การตรวจสอบ เพื่อสนับสนุนการดำเนินงานของคณะกรรมการมูลนิธิการแพทย์ฉุกเฉินแห่งชาติ และของฝ่ายต่าง ๆ
๕. ฝ่ายจัดหาทุน มีหน้าที่ ระดมทุนต่าง ๆ ทั้งหน่วยงานภาครัฐ ภาคเอกชน รวมทั้งการจัดตั้งกองทุนต่าง ๆ ตามที่ผู้บริจาคระบุทั้งในประเทศและต่างประเทศ
๖. ฝ่ายสวัสดิการมีหน้าที่จัดและส่งเสริมสวัสดิการและสร้างขวัญกำลังใจให้แก่เจ้าหน้าที่และอาสาสมัครผู้ปฏิบัติงานในระบบการแพทย์ฉุกเฉิน รวมถึงอำนวยความสะดวกแก่คณะกรรมการมูลนิธิการแพทย์ฉุกเฉินแห่งชาติ
๗. ฝ่ายกิจการพิเศษ มีหน้าที่กำหนดกิจกรรมพิเศษต่างๆของมูลนิธิ เช่น การรณรงค์สร้างภาคีเครือข่ายจิตอาสา การรณรงค์หาทุน ฯลฯ รวมถึงการประสานและกำกับดูแลกิจกรรมต่างๆให้ดำเนินไปด้วยความเรียบร้อยและวางแผนจัดงบประมาณเพื่อสนับสนุนการจัดกิจกรรมพิเศษต่าง ๆ
๘. สำนักงานมูลนิธิการแพทย์ฉุกเฉินแห่งชาติ มีหน้าที่ ดำเนินงานบริหารจัดการและสนับสนุนการดำเนินงานของคณะกรรมการมูลนิธิการแพทย์ฉุกเฉินแห่งชาติและของฝ่ายต่างๆ